Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Garnl3Q3V0G7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms