Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc55Q3UY51 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms