Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fchsd2Q3USJ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fchsd2Q3USJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms