Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc190Q3URK1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms