Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln5Q3UMW8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cln5Q3UMW8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms