Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpr55Q3UJF0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms