Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft2Q3UF64 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms