Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam35aQ3UEN2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms