Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde12Q3TIU4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pde12Q3TIU4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms