Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B3Q16720 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms