Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ptchd1Q14B62 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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