Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spatc1Q148B6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Spatc1Q148B6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms