Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK13Q14004 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
CDK13Q14004 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
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