Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SobpQ0P5V2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms