Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fmn1Q05860 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Fmn1Q05860 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Fmn1Q05860 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms