Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk16Q04735 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms