Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nf1Q04690 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nf1Q04690 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms