Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdk7Q03147 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk7Q03147 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms