Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EgfrQ01279 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EgfrQ01279 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EgfrQ01279 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms