Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms