Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capza3P70190 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capza3P70190 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capza3P70190 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capza3P70190 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Capza3P70190 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capza3P70190 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Capza3P70190 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capza3P70190 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capza3P70190 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capza3P70190 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Capza3P70190 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms