Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms