Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc4rP56450 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc4rP56450 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc4rP56450 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc4rP56450 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc4rP56450 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mc4rP56450 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms