Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PolgP54099 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolgP54099 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolgP54099 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolgP54099 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolgP54099 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolgP54099 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolgP54099 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PolgP54099 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolgP54099 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolgP54099 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolgP54099 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolgP54099 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolgP54099 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolgP54099 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolgP54099 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PolgP54099 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolgP54099 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolgP54099 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolgP54099 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolgP54099 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolgP54099 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolgP54099 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolgP54099 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PolgP54099 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolgP54099 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolgP54099 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolgP54099 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolgP54099 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolgP54099 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolgP54099 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PolgP54099 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolgP54099 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolgP54099 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolgP54099 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolgP54099 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolgP54099 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolgP54099 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolgP54099 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolgP54099 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolgP54099 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolgP54099 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolgP54099 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolgP54099 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolgP54099 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolgP54099 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolgP54099 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolgP54099 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolgP54099 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolgP54099 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolgP54099 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolgP54099 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolgP54099 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolgP54099 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolgP54099 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolgP54099 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolgP54099 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolgP54099 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolgP54099 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolgP54099 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolgP54099 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolgP54099 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolgP54099 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolgP54099 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolgP54099 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PolgP54099 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolgP54099 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolgP54099 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms