Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab2aP53994 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms