Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav1P49817 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cav1P49817 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cav1P49817 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cav1P49817 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cav1P49817 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cav1P49817 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms