Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3P48787 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnni3P48787 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 883.1 ms