Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX2P40425 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX2P40425 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX2P40425 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX2P40425 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX2P40425 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX2P40425 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX2P40425 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX2P40425 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX2P40425 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX2P40425 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX2P40425 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX2P40425 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX2P40425 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX2P40425 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX2P40425 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PBX2P40425 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX2P40425 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX2P40425 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX2P40425 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX2P40425 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX2P40425 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX2P40425 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX2P40425 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX2P40425 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX2P40425 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX2P40425 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX2P40425 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX2P40425 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX2P40425 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX2P40425 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX2P40425 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX2P40425 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX2P40425 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX2P40425 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX2P40425 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX2P40425 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX2P40425 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX2P40425 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX2P40425 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX2P40425 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX2P40425 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX2P40425 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX2P40425 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX2P40425 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX2P40425 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX2P40425 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX2P40425 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX2P40425 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX2P40425 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX2P40425 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX2P40425 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX2P40425 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX2P40425 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX2P40425 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX2P40425 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX2P40425 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX2P40425 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX2P40425 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX2P40425 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX2P40425 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBX2P40425 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBX2P40425 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX2P40425 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX2P40425 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX2P40425 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX2P40425 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms