Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptger1P35375 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptger1P35375 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptger1P35375 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptger1P35375 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptger1P35375 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptger1P35375 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptger1P35375 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptger1P35375 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptger1P35375 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptger1P35375 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptger1P35375 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptger1P35375 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptger1P35375 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptger1P35375 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptger1P35375 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptger1P35375 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptger1P35375 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptger1P35375 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptger1P35375 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptger1P35375 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptger1P35375 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptger1P35375 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptger1P35375 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptger1P35375 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptger1P35375 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptger1P35375 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptger1P35375 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptger1P35375 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptger1P35375 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptger1P35375 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptger1P35375 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptger1P35375 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptger1P35375 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptger1P35375 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptger1P35375 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptger1P35375 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptger1P35375 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptger1P35375 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptger1P35375 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptger1P35375 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptger1P35375 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptger1P35375 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptger1P35375 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptger1P35375 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptger1P35375 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptger1P35375 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptger1P35375 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptger1P35375 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms