Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NapbP28663 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NapbP28663 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NapbP28663 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NapbP28663 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NapbP28663 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NapbP28663 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NapbP28663 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NapbP28663 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NapbP28663 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapbP28663 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapbP28663 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapbP28663 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapbP28663 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapbP28663 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapbP28663 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NapbP28663 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapbP28663 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapbP28663 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapbP28663 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapbP28663 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NapbP28663 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapbP28663 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapbP28663 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NapbP28663 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NapbP28663 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NapbP28663 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NapbP28663 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NapbP28663 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NapbP28663 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NapbP28663 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NapbP28663 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NapbP28663 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NapbP28663 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NapbP28663 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NapbP28663 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapbP28663 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NapbP28663 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NapbP28663 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NapbP28663 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NapbP28663 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NapbP28663 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapbP28663 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapbP28663 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapbP28663 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapbP28663 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NapbP28663 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NapbP28663 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NapbP28663 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapbP28663 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapbP28663 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapbP28663 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapbP28663 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapbP28663 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapbP28663 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapbP28663 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapbP28663 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapbP28663 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapbP28663 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapbP28663 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapbP28663 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapbP28663 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapbP28663 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NapbP28663 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NapbP28663 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NapbP28663 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NapbP28663 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NapbP28663 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NapbP28663 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NapbP28663 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NapbP28663 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NapbP28663 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NapbP28663 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NapbP28663 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NapbP28663 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NapbP28663 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NapbP28663 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NapbP28663 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NapbP28663 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NapbP28663 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NapbP28663 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NapbP28663 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NapbP28663 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NapbP28663 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NapbP28663 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NapbP28663 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NapbP28663 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NapbP28663 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NapbP28663 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NapbP28663 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms