Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd9P28357 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd9P28357 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms