Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgfb3P17125 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgfb3P17125 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgfb3P17125 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms