Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb2P13373 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms