Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODC1P11926 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODC1P11926 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODC1P11926 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODC1P11926 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ODC1P11926 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODC1P11926 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODC1P11926 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODC1P11926 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODC1P11926 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODC1P11926 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODC1P11926 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODC1P11926 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODC1P11926 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODC1P11926 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODC1P11926 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODC1P11926 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODC1P11926 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODC1P11926 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODC1P11926 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ODC1P11926 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODC1P11926 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ODC1P11926 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODC1P11926 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODC1P11926 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODC1P11926 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODC1P11926 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODC1P11926 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODC1P11926 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODC1P11926 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODC1P11926 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODC1P11926 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODC1P11926 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ODC1P11926 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ODC1P11926 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ODC1P11926 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ODC1P11926 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODC1P11926 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODC1P11926 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODC1P11926 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODC1P11926 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODC1P11926 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODC1P11926 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODC1P11926 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ODC1P11926 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ODC1P11926 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ODC1P11926 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ODC1P11926 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ODC1P11926 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODC1P11926 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODC1P11926 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODC1P11926 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODC1P11926 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODC1P11926 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODC1P11926 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODC1P11926 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODC1P11926 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ODC1P11926 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODC1P11926 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODC1P11926 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODC1P11926 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODC1P11926 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODC1P11926 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODC1P11926 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODC1P11926 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ODC1P11926 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ODC1P11926 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ODC1P11926 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ODC1P11926 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ODC1P11926 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODC1P11926 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODC1P11926 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ODC1P11926 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODC1P11926 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODC1P11926 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms