Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PolP11369 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PolP11369 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PolP11369 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolP11369 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PolP11369 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolP11369 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PolP11369 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PolP11369 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PolP11369 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolP11369 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolP11369 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolP11369 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolP11369 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolP11369 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PolP11369 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolP11369 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolP11369 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolP11369 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolP11369 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PolP11369 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PolP11369 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PolP11369 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolP11369 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolP11369 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolP11369 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolP11369 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolP11369 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolP11369 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolP11369 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolP11369 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolP11369 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolP11369 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolP11369 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolP11369 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolP11369 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolP11369 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolP11369 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolP11369 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolP11369 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolP11369 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolP11369 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolP11369 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolP11369 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolP11369 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolP11369 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolP11369 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolP11369 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolP11369 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolP11369 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolP11369 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolP11369 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolP11369 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolP11369 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolP11369 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolP11369 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolP11369 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolP11369 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolP11369 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolP11369 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolP11369 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolP11369 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolP11369 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolP11369 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolP11369 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PolP11369 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolP11369 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolP11369 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolP11369 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolP11369 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolP11369 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolP11369 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolP11369 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolP11369 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolP11369 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolP11369 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms