Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Amd1P0DMN7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Amd1P0DMN7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms