Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh1P0CB42 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Alkbh1P0CB42 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms