Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CENPBP07199 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CENPBP07199 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CENPBP07199 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CENPBP07199 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CENPBP07199 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CENPBP07199 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CENPBP07199 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CENPBP07199 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CENPBP07199 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CENPBP07199 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CENPBP07199 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CENPBP07199 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CENPBP07199 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CENPBP07199 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CENPBP07199 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CENPBP07199 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CENPBP07199 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CENPBP07199 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CENPBP07199 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CENPBP07199 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CENPBP07199 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CENPBP07199 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CENPBP07199 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CENPBP07199 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CENPBP07199 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPBP07199 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPBP07199 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPBP07199 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPBP07199 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPBP07199 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPBP07199 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPBP07199 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPBP07199 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPBP07199 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPBP07199 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPBP07199 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPBP07199 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPBP07199 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPBP07199 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPBP07199 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPBP07199 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPBP07199 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPBP07199 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPBP07199 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPBP07199 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPBP07199 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPBP07199 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPBP07199 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPBP07199 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPBP07199 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPBP07199 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPBP07199 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPBP07199 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPBP07199 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPBP07199 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPBP07199 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPBP07199 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPBP07199 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPBP07199 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPBP07199 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPBP07199 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPBP07199 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPBP07199 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPBP07199 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPBP07199 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPBP07199 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPBP07199 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPBP07199 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPBP07199 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPBP07199 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPBP07199 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPBP07199 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPBP07199 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPBP07199 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPBP07199 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPBP07199 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPBP07199 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPBP07199 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPBP07199 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPBP07199 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPBP07199 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPBP07199 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPBP07199 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPBP07199 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPBP07199 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPBP07199 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPBP07199 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPBP07199 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPBP07199 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPBP07199 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPBP07199 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPBP07199 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPBP07199 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPBP07199 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPBP07199 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPBP07199 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPBP07199 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPBP07199 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPBP07199 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms