Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06334 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06334 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06334 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06334 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06334 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06334 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P06334 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06334 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06334 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06334 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06334 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06334 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06334 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06334 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06334 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06334 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06334 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms