Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl1P05977 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl1P05977 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl1P05977 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl1P05977 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl1P05977 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl1P05977 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl1P05977 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl1P05977 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl1P05977 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myl1P05977 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myl1P05977 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms