Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
P01735 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01735 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01735 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01735 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01735 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01735 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01735 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01735 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01735 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01735 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01735 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01735 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01735 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01735 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01735 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01735 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01735 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01735 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01735 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01735 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01735 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01735 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01735 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01735 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01735 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
P01735 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01735 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01735 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01735 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01735 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01735 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01735 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01735 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01735 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01735 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
P01735 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01735 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01735 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01735 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01735 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01735 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01735 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01735 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01735 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01735 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01735 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01735 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01735 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01735 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01735 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01735 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01735 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01735 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01735 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01735 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01735 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01735 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01735 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
P01735 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01735 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01735 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01735 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01735 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01735 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01735 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01735 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01735 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01735 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01735 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01735 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01735 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01735 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01735 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01735 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01735 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01735 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01735 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms