Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnk2O54967 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnk2O54967 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnk2O54967 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms