Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab33bO35963 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab33bO35963 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms