Protein–RNA interactions for Protein: O35618

Mdm4, Protein Mdm4, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm4O35618 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mdm4O35618 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdm4O35618 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdm4O35618 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms