Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq1O09165 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casq1O09165 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casq1O09165 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms