Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrkcshO08795 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrkcshO08795 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.1 ms