Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r78K7N6U5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r78K7N6U5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r78K7N6U5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms