Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sclt1G5E861 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms