Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pcf11G3X9Z4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Pcf11G3X9Z4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pcf11G3X9Z4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms