Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nccrp1G3X9C2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nccrp1G3X9C2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nccrp1G3X9C2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms